歷史沿革
中國科學院亞熱帶農業生態研究所（以下簡稱“研究所”）創建于1978年，其前身為中國科學院長沙農業現代化研究所，2003年10月改為現名。1982年至1990年，我所掛靠中國科學院南京土壤研究所合作培養土壤與農業化學專業研究生；1985年至1991年，掛靠北京師范大學合作培養經濟地理專業碩士研究生；1991年至1999年，掛靠中國科學院遺傳研究所合作培養遺傳學專業研究生；1992年至2002年，掛靠中國科學院動物研究所合作培養嚙齒動物生態專業研究生。
1998年6月我所獲批生態學一級學科碩士學位點，2003年獲批生態學一級學科博士學位點。2003年獲批動物營養與飼料科學二級學科碩士點，2012年獲批畜牧學一級學科碩士點。2012年獲批環境科學專業（現資源與環境科學專業）學位碩士點。
目前我所擁有生態學博士后流動站，生態學一級學科博士點，畜牧學一級學科碩士點和資源與環境一級學科專業學位碩士點。
師資隊伍
研究所現有博士生導師20名（含國內外兼職博導8名），碩士生導師34名。師資隊伍中師資隊伍中現有中國工程院院士1人，國家杰出青年科學基金項目獲得者1人，國家優秀青年科學基金項目獲得者2人，國家“百千萬人才”高層人選2人，國家“創新人才推進計劃”中青年科技創新領軍人才2人，國家“創新人才推進計劃”重點領域創新團隊2個，全國優秀科技工作者1人，全國扶貧先進個人1人，中國科學院創新交叉團隊1個，“西部之光”入選者27人，中國科學院特聘研究員5人，中國科學院“王寬誠率先人才計劃”產研人才扶持項目1人，中國科學院“盧嘉錫青年人才獎”獲得者1人，中國科學院青促會會員20人，中國科學院院青促會優秀會員6人，湖南省科技領軍人才5人，湖南光召科技獎1人，湖南省“十大同心人物”2人，湖湘青年英才5人，湖南省“杰青”8人，湖南省科技創新人才計劃優秀博士后創新人才項目1人，長沙市杰出創新青年培養計劃3人。
科研條件
亞熱帶生態所主要學科方向為亞熱帶復合農業生態系統生態學，下設喀斯特區域農業生態、農田生態、濕地農業生態、流域農業環境、畜禽健康養殖與農牧復合生態、作物分子生態等六個研究中心，作為依托單位擁有畜禽養殖污染控制與資源化技術國家工程實驗室、中國科學院亞熱帶農業生態過程重點實驗室、農業生態工程湖南省重點實驗室、湖南省動物營養與生理代謝過程重點實驗室、湖南省畜禽健康養殖工程技術研究中心和廣西石漠化治理工程技術研究中心。實驗室面積 17000 余平米，儀器設備近 9700 萬元。
在代表亞熱帶類型區的紅壤丘陵區、喀斯特山區和平原湖區分別設立了桃源農田生態系統觀測研究站、環江喀斯特生態系統觀測研究站和洞庭湖濕地生態系統觀測研究站，3 個站均為中國科學院生態網絡監測系統基本站，其中桃源站、環江站和洞庭湖站為國家野外臺站，洞庭湖站已被納入國務院三峽辦三峽工程生態環境監測網絡。另還建有長沙金井農業環境研究站（已納入國家水土保 持示范園區）、海南水稻南繁試驗基地、長沙水稻育種基地、亞熱帶區域農業生態要素數據庫等。湖南省生態學會、湖南省土壤學會、湖南省動物營養與生態環境學會掛靠我所，主辦有《農業現代化研究》期刊。
科學研究
2020年研究所在研項目總數585項。主持國家自然科學基金重點和聯合基金項目11項、優青項目1項、面上和青年項目等96項；承擔國家重點研發計劃項目4項；參與承擔中科院先導專項項目13項；主持中科院STS計劃項目14項；承擔地方科技項目135項。2020年新增項目經費10260萬元，到賬項目經費12386萬元?？蒲谐晒麑耀@獎勵，2020年“廣西喀斯特區石漠化治理與適應性生態恢復技術研究示范”與“石山貧困區生態高值特色扶貧產業培育關鍵技術與應用”成果分別獲廣西區科技進步一等獎和二等獎，“農業農村水污染源頭生態治理關鍵技術創建及其在南方的應用”成果獲湖南省科技進步一等獎。同時，制定了農用地土壤重金屬污染修復評價地方標準，研發了優質地方豬（寧鄉豬、沙子嶺豬）豬肉形成機制與營養調控技術，實現了喀斯特關鍵水文過程精準模擬，構建了農田氮磷流失防控決策支持系統，制定了洞庭湖流域濕地保護實施方案，篩選出抗除草劑和抗蟲重大育種價值基因，形成了解決區域重大農業生態環境問題的亮點成果。發表論文質量大幅提升。2020年發表第一單位SCI論文109篇，TOP論文比例達到45.19%，一二區SCI論文比例達到72.1%。此外，受理申請發明專利29項，授權發明專利16項。
人才培養
研究所現有在學國科大學籍研究生181人，其中碩士生79人，博士生102人（含1名CAS-TWAS博士生），聯合培養研究生100余人。每年自主招收博士研究生20名左右，碩士研究生30名左右。
獎助學金
研究所為研究生設置有完善的獎助學金體系，可保障研究生在學期間的基本生活。國家實施研究生收學費后，研究所新設立了學業獎學金，將所收學費全額返回給了學生。除此外，原設立的碩士生、博士生獎助學金已分別提高到2200元/月、3850元/月，同時，還擇優資助中國科學院各類冠名獎學金、企業獎學金。
招生專業
生態學博士點；生態學、畜牧學學術型碩士點；資源與環境專業學位碩士點。